Родился в Полтавской губернии в семье протоиерея Павла Бойко. Отец репрессирован. Михаила забрали у матери и отдали в детский дом. В 17 лет, прибавив себе год возраста, пошёл добровольцем на фронт. Как вспоминал, отец Михаил, на фронте он не просил у Бога остаться живым. Он молился: Господи, дай мне быть с тобой! Здесь ли на земле, или там в ином мире, но дай мне быть с Тобой! И прошёл всю войну, расписался в мае 1945 на рейхстаге в Берлине. Когда бои уже стихали, его контузила пуля, ударившая рикошетом в челюсть. Челюсть распухла. Он не мог ни есть, ни пить. Пошёл в санчасть. В душе заскорбел: пройти все бои, а тут досадная контузия: ни есть, ни пить. Когда возвращался в часть, то увидел, как в повозке везут его боевых друзей. Они были вроде бы в сознании. но ничего не соображали, с выпученными глазами кричали от боли и мук. Нашли где-то на железнодорожных путях цистерну со спиртом. "Если бы Бог мне не послал контузию, я бы выпил бы с ними за Победу!", - со слезами вспоминал Батюшка. Он за них, умерших в последний день войны, молился всю жизнь... После войны поступил в возрожденную Киевскую семинарию, женился, из обломков ящиков построил себе дом на Ширме (район Киева). Рукоположен в сан диакона. Обладал абсолютным слухом, играл на многих инструментах, а главное - великолепно совершал богослужение, красиво, благоговейно, торжественно. У него 8 детей, 40 внуков, и тысячи духовных чад, которые сейчас живут по всему миру. Протоиерей Михаил Бойко несколько десятилетий служил в Покровском монастыре, был духовником Киевской епархии.